篇一：BNET,JOBS,演讲技巧
篇一：乔布斯的演讲技巧
乔布斯的演讲技巧：教你站在讲台上怎样化腐朽为神奇
来源：沪江英语 日期: 2011-10-28
导读：乔布斯的逝去，不仅让it界损失了一代奇才，同时也让我们失去了一个很了不起的presenter，我们都爱他的presentation，是什么原因呢？camine gallo为我们分享乔布斯的演讲技巧。
camine gallo 讲解乔布斯演讲技巧的中英文对照演讲稿：
anyone who is watched the steve job’s keynote, will tell you, he is one of the most extraordinary speakers and cooperators in america.但凡看过steve jobs的主题演讲的人都觉得，他是全美最棒的演说家，最了不起的合作伙伴。
-who does the best job of that in the world?
-这个行当里谁最牛?
well, most presenter simply convey information, jobs inspires.多数演讲者只是简单地传达信息，乔布斯的演讲却能点燃激情。
im camine gallo. and today ill walk you to several key techniques that steve jobs uses to electrify his audience, the relevants you can adopt for your very next presentation.
我是卡迈恩·加洛，今天我将带领你们领略乔布斯的演讲艺术，教您如何在演讲中化腐朽为神奇。
-欢迎来到2008苹果大会今天要给大家带来非同凡响的新产品
-theres clearly something in the air today.
-有没有感受到它们的小宇宙即将爆发?
with those words jobs open mac pro 2008, setting the theme for his presentation and hitting the major announcement of the day by launchingthe ultra thin mac book air. whether its the notebook or the iphone, jobs unveils a single headline that set the theme.
乔布斯开场的寥寥几句就揭示了大会主题营造出了mac book air的发布氛围。不管是发布mac book还是iphone 乔布斯只用简单的一句话就点明了主题——
-today apple is going to reinvents the phone.
-今天苹果将掀起一场手机革命!
一旦你确立演讲主题，整个演讲就要清晰地围绕这个主题来展开。例如，要在员工大会上推广一款追踪销售数据的软件。你可以这样开场:早上好，感谢大家参加会议。我知道大家都很期待，让我们直奔主题：如何轻松完成工作配额。如何完成工作配额，这个主题令人印象深刻。而且接下来怎么说一目了然相信听众会非常乐意倾听下去。
-i got four things id like to talk about with you today. so lets get started. steve jobs always provides an outline for his presentation and then verbally opens and closes each section with clear transition and between. heres an example.
-今天我有4项成果要与大家分享...演讲开始乔布斯列出一个大纲，并明确告诉听众每个部分何时开始，何时结束。例如：
-这就是time capsule，完美的系统伴侣。
-and thats the first thing i wanna share with you this morning.-这是我要发布的第一款产品。the point is, make it easy for your listeners to follow your story. your outline will serves as guide post along the way. you also know that during his presentation jobs uses words like extraordinary, amazing and cool. he is passionate,
enthusiastic and it shows.
为了让听众不会半路跟丢，大纲会是一个不错的选择。它就像路标指引着听众紧跟你的步伐。在乔布斯的演讲中，你还会听到这样一些词:非同凡响、华丽丽、酷毕了。这些词汇充分展现了他的兴奋与激动。
-incredible, unbelievable, awesome, extraordinary year for apple.-对于苹果来说，这是难以想象、非同凡响的一年。
好的演讲应该振奋人心而不是催人睡下。枯燥、严肃、乏味的演讲放倒了一帮又一群的听众。那样的演讲我们不爱听、有趣、有激情地展现公司的产品，这才是我们需要的。
if you are not passionate about it, we are not going to be. remember, jobs isn’t selling hardware. hes selling an experience. if you offer numbers and statistics, make them meaningful.
如果你在那玩深沉，我们观众又怎么可能会激情四射。乔布斯从头至尾都不是在兜售产品，而是推销一种体验。如果要引用数据，请赐予它意义吧。-we have sold 4 million iphones to date.
-迄今为止，我们一共售出了4百万部iphone 。
-we divide 4 million by 200 days, thats 20,000 iphones every day on average. -用4百万除以200，意味着我们平均每天卖出了2万部iphone。
数字本身没有意义，除非放入特殊的语境。要让这些数字有意义，给它们来点比方吧。最近我在和一个公司合作，这个公司刚刚发布了新的12g内存卡。12g啊！但是多数人不明白12g是个什么概念。所以我给这个数字包装了下，12g的存储量足够让你听着音乐在地球和月球之间兜上一圈。看，这回12g就厉害啦。赶紧地动手包装下数据吧。
one of the most effective elements of steve jobss presentation is that they are easy on the eyes. his presentations are visual and simple.乔布斯演讲的法宝就是视觉刺激。他的演讲不仅非常视觉化，而且通俗易懂。well, most speakers fill their slides, with = =| data, texts and charts, jobs does just the opposite. he uses very little text, and usually one, maybe two images for his slide.
大多数的演讲者喜欢在幻灯片里塞进大量的数据、文字和图表乔布斯却不这么干。他用丰富的视觉盛宴替代繁冗的文字图表，通常每个幻灯片也只有一两张图片而已。
you see you want to paint a picture for your audience, without overwhelming them. inspiring presentations are short on bullet points and big on visuals. if you really want your presentations to pop, treat it like a show, when ads flows, themes and transitions. jobs includes video clips, demonstrations and guests, he also has a natural for dramatic flare. it’s very effective. for example we are introducing the macbook air, jobs drew chairs by opening a manila inter office envelope, holding the laptop for everyone to see.
在合适的时刻展现合适的内容，而不是连篇累牍、铺天盖地砸向听众。好的演讲通常只列出简明扼要的观点，其他的全是演示。想要演讲得出类拔萃，就把它当作一场达人秀:各种广告、各种主题、各种变幻...乔布斯就用到了视频剪辑、样品展示、客串嘉宾...有时还会来个出其不意。别说，倒还真挺见效。比如在发布mac book air时，他打开一个大信封，默默抽出了这个新款笔记本电脑，观众们瞬间石化了。
-this is the new, mac book air, you can get a feel for how thin it is.
-这就是最新款mac book air, 知道它有多薄了吧。what is the one memorable moment of your presentation? identify your memorable moment and build up to it. -...climax of the show -...our friends and everyone in the world today.
你演讲中最难忘的瞬间是什么？定下那一刻，然后使出浑身解数把听众引向那里。
and finally, rehearse, rehearse, and rehearse some more.最后一条，彩排，彩排，再彩排。
-let me show you how easy that is now.
-让你们见识下操作起来有多简单
steve jobs makes it look easy because he spends hours rehearsing. he cannot pull off an intro presentation with a video clips and
demonstrations and outside speakers without practice. the result of presentation that is perfect synchronized and looks, yes effortless. now the average business first does not have a resource to create a steve jobss extraordinary ganza. but you do have time to rehearse. the greatest presenters do it, so should you.
乔布斯的演示之所以看起来如此简单是因为他花了大量时间来彩排。没有反复的练习，那些视频剪辑、样品展示和客串嘉宾便都是浮云。因为反复的彩排，他才能在演讲过程中如此淡定，如此收放自如。当然很少有人生来就像乔布斯这样天赋异禀。但早起的鸟儿有虫吃的道理，你懂的，你总会有足够的时间去彩排。瞧瞧，人乔布斯还彩排呢，你为什么不呢?
oh, and one more thing. at the end of most presentations, jobs add to the drama by saying “and one more thing?”
哦，还有一点。通常在演讲的结尾jobs会加上一句最后一项...
-one last thing? he gonna adds a new product, or feature, sometimes just introduces a band.
-最后一项...他会继续介绍一个新产品、新特性、或是给乐队当回司仪。its not only the highest excitement, it also leaves your audience feel they been given an added bonus. the point is steve jobs approaches each presentation as an invent. a production with strong opening, product demonstrations in the middle and strong conclusion. and then yes, even a anchor, that one more thing?. i wish you a dazzling presentation.篇二：
【乔布斯的演讲技巧】教你在讲台上化腐朽为神奇
【乔布斯的演讲技巧】教你在讲台上化腐朽为神奇 但凡看过steve jobs的主题演讲的人都觉得，他是全美最棒的演说家，最了不起的合作伙伴。
多数演讲者只是简单地传达信息，乔布斯的演讲却能点燃激情。
今天我将带领你们领略乔布斯的演讲艺术，教您如何在演讲中化腐朽为神奇。
-theres clearly something in the air today.
-有没有感受到它们的小宇宙即将爆发?
乔布斯开场的寥寥几句就揭示了大会主题 营造出了mac book air的发布氛围。不管是发布mac book还是iphone 乔布斯只用简单的一句话就点明了主题——
-today apple is going to reinvents the phone.
-今天 苹果将掀起一场手机革命!
一旦你确立演讲主题，整个演讲就要清晰地围绕这个主题来展开。例如，要在员工大会上推广一款追踪销售数据的软件。你可以这样开场:早上好，感谢大家参加会议。我知道大家都很期待，让我们直奔主题：如何轻松完成工作配额。如何完成工作配额，这个主题令人印象深刻。而且接下来怎么说一目了然 相信听众会非常乐意倾听下去。
-i got four things id like to talk about with you today. so lets get started. steve jobs always provides an outline for his presentation and then verbally opens and closes each section with clear transition and between. heres an example.
-今天我有4项成果要与大家分享...演讲开始 乔布斯列出一个大纲，并明确告诉听众每个部
分何时开始，何时结束。例如：
-这就是time capsule，完美的系统伴侣。
-and thats the first thing i wanna share with you this morning. -这是我要发布的
第一款产品。
为了让听众不会半路跟丢，大纲会是一个不错的选择。它就像路标指引着听众紧跟你的步伐。在乔布斯的演讲中，你还会听到这样一些词:非同凡响、华丽丽、酷毕了。这些词汇充分展现了他的兴奋与激动。
-incredible, unbelievable, awesome, extraordinary year for apple. -对于苹果来说，这是难以想象、非同凡响的一年。
好的演讲应该振奋人心而不是催人睡下。枯燥、严肃、乏味的演讲放倒了一帮又一群的听众。那样的演讲我们不爱听、有趣、有激情地展现公司的产品，这才是我们需要的。
如果你在那玩深沉，我们观众又怎么可能会激情四射。乔布斯从头至尾都不是在兜售产品，而是推销一种体验。如果要引用数据，请赐予它意义吧。
-we have sold 4 million iphones to date.
-迄今为止，我们一共售出了4百万部iphone 。
-we divide 4 million by 200 days, thats 20,000 iphones every day on average. -用4百万除以200，意味着我们平均每天卖出了2万部iphone。
数字本身没有意义，除非放入特殊的语境。要让这些数字有意义，给它们来点比方吧。最近我在和一个公司合作，这个公司刚刚发布了新的12g内存卡。12g啊！但是多数人不明白12g是个什么概念。所以我给这个数字包装了下，12g的存储量 足够让你听着音乐在地球和月球之间兜上一圈。看，这回12g就厉害啦。赶紧地动手包装下数据吧。
乔布斯演讲的法宝就是视觉刺激。他的演讲不仅非常视觉化，而且通俗易懂。 大多数的演讲者喜欢在幻灯片里塞进大量的数据、文字和图表 乔布斯却不这么干。他用丰富的视觉盛宴替代繁冗的文字图表，通常每个幻灯片也只有一两张图片而已。
在合适的时刻展现合适的内容，而不是连篇累牍、铺天盖地砸向听众。好的演讲通常只列出简明扼要的观点，其他的全是演示。想要演讲得出类拔萃，就把它当作一场达人秀:各种广告、各种主题、各种变幻...乔布斯就用到了视频剪辑、样品展示、客串嘉宾...有时还会来个出其不意。别说，倒还真挺见效。比如在发布mac book air时，他打开一个大信封，默默抽出了这个新款笔记本电脑，观众们瞬间石化了。
-this is the new, mac book air, you can get a feel for how thin it is. -这就是最新款mac book air, 知道它有多薄了吧。
你演讲中最难忘的瞬间是什么？定下那一刻，然后使出浑身解数把听众引向那里。 最后一条，彩排，彩排，再彩排。
-let me show you how easy that is now. -让你们见识下 操作起来有多简单
乔布斯的演示之所以看起来如此简单是因为他花了大量时间来彩排。没有反复的练习，那些视频剪辑、样品展示和客串嘉宾便都是浮云。因为反复的彩排，他才能在演讲过程中如此淡定，如此收放自如。当然很少有人生来就像乔布斯这样天赋异禀。但早起的鸟儿有虫吃的道理，你懂的，你总会有足够的时间去彩排。瞧瞧，人乔布斯还彩排呢，你为什么不呢? 哦，还有一点。通常在演讲的结尾 jobs会加上一句 最后一项...
-one last thing? he gonna adds a new product, or feature, sometimes just introduces a band.
-最后一项...他会继续介绍一个新产品、新特性、或是给乐队当回司仪。
这不仅仅是整个演讲的高潮，还能让观众觉得他们中了头彩。乔布斯把每一次演讲都当成产品去打造、去创新。赋予了演讲一个震撼的开场，一个高潮迭起的过程，和一个令人流连的
尾声。对了 还有那句撩人的 最后一项...希望你们的演讲也能同样精彩!篇三：steve jobs的五个演讲秘诀
steve jobs的五个演讲秘诀
business week杂志近期刊登了一篇题为《steve jobs presentation secrets》的文章，写的不错，我特地做了几页ppt把当中的关键点摘录出来，与大家分享。
steven jobs就不用多介绍了吧，呵呵，传奇般的人生造就一位商业奇才！史蒂夫·乔布斯（steven jobs）是所有学习演讲和学做ppt的人的榜样，他的演讲，尤其是演示风格也深深影响了无数的演讲高手。乔布斯会对每个产品进行定位，为此设置一个主题。举例来说，他对macbook air的描述是“全球最薄的笔记本电脑”。这一描述出现在他的演讲幻灯片上，出现在苹果的网站以及新闻稿上。你最希望消费者了解你产品的哪一个特点？这个主题必须符合你所有的营销和陈述内容
在1984年，苹果眼中的靶子就是ibm。在乔布斯第一次向苹果销售团队推出那则著名的1984电视广告前，他讲述了一个关于ibm如何决意统治电脑行业的故事。乔布斯当时说：“ibm希望主宰整个电脑行业，现在他们正将枪口对准了操纵行业的最后一道障碍：苹果。”现在苹果嘴里的靶子成为了微软。如果让听众感到你和他们拥有共同的敌人，那么就能有效地激起他们的斗志，将消费者转变为你的传教士
乔布斯发布会所使用的幻灯片均是令人惊讶的简明扼要，没有繁文缛节。图片就是最重要的要素。当乔布斯发布macbook air的时候，有一张图片显示一只手从一个普通的文件纸袋中掏出这部电脑，这张图片胜过了一切语言。而有些时候，乔布斯在10张幻灯片中总共只使用了7个词
神经学家发现大脑很容易感到厌倦。乔布斯不会让你有时间失去兴趣。他通常只花10分钟展示一个新产品或新功能，而且乐趣丛生。乔布斯在2007年macworld大会上推出iphone的时候，他展示了谷歌地图是如何在iphone上使用的。乔布斯通过iphone查到了当地的星巴克商店清单，然后说“让我们打一个试试”。于是他拨通了电话，乔布斯当着全场观众对电话另一端说，“我要订4000杯拿铁咖啡。不，只是开个玩笑”
篇二：电脑配置建议
1. CPUCPU好比一个人的大脑，CPU的运算能力就像平时心算，心算速度越快CPU的性能就越好。AMD目前不给力,3A平台也只能在低端系列拼一拼，高端还是Intel的天下。Intel CPU推荐赛扬系列：G1610、G1620、G1820奔腾系列：G2020、G2030、G3220酷睿 I 5：3470、3570、3570K、4670K酷睿 I7：3770、4770、3770K、4770K至强系列：E3-1230V2、E3-1230V3个人觉得Intel的奔腾和赛扬系列CPU足够满足平常办公、上网、看电影、玩玩小游戏等日常需求了。酷睿系列CPU足以应付目前大多数3D网游和单机游戏，I3目前性价比低，有种低不成高不就的感觉。游戏机还是咬咬牙上I5，不会超频就选I5-3470、I5-4570。想折腾的就选择带K的CPU，比如I5-3570K、I5-4670K。工作设计、高帅富土豪类直接上至强和I7系列不纠结，在土豪面前毫无性价比可言，玩得爽才是王道。说明一下：CPU盒装和散片的差别在于是否是正规的质保，原盒是3年质保，而散片(无散热器，就一个CPU)大多是店铺质保一年。
2. 散热个人认为原装的散热基本上能够满足需求，当然如果你买的是散片CPU不妨多花点钱，无论从散热还是噪音方面都有不错的提升。CPU散热推荐九州风神玄冰400、九州风神霜塔、采融B81、利民HR-02M
3. 主板主板好比人体的骨架，能做多少活，能干多大事还需看主板。世界一线主板大厂已被华硕、技嘉、华擎三分天下，微星已被华硕的子公司华擎成功地小三上位。低端不会超频的用H81/B85主板最佳，高端不差钱又想折腾的直接Z87不纠结，至于具体到那个型号，看自己需求什么样的功能即可。个人建议直接上华擎各系列，这种BIOS方便超频，价格便宜量又足！
4. 内存内存好比人体的神经，把脑和脊髓的兴奋传给各个器官，或把各个器官的兴奋传给脑和脊髓，相当于说内存越大对事件处理的速度越快。个人觉得4G勉强够用，8G还算可以，12G以上看个人的需求。威刚、海盗船、金士顿、芝奇、宇瞻……品牌比较多就不一一推荐了，不超频直接网上商城买金士顿。实体店千万别买金士顿，可以选宇瞻或者威刚的。
5. 显卡 显卡好比人脸化妆，你可以选择不化妆，也可以去做韩国美女。目前比较出名的显卡厂商有技嘉、蓝宝石、华硕、微星、迪兰恒进、HIS、映众，游戏类显卡竞争最激烈，而且价位又互相错开。N卡低端买650，中低端买650TI，中端买660，中高端买760，高端买770。切记显卡型号第二位数少于5（不包括5），比如210、430、640等等绝对是垃圾！A卡低端买7750，中端买7770或260X，中高端买R270X，高端买R280X。切记显卡型号第三位数少于5（包括5），比如5450、6450等等绝对是垃圾，另外新系列显卡R250性价比低也不建议购买。
6. 硬盘大水过后500G和1TB的差价很小了，最好直接上单碟1TB的。推荐希捷西部数据，个人觉得希捷是慢慢死的，有时间给你转移数据；西部数据说挂就挂，根本没给你挽救的时间。SSD是未来的发展。
7. 机箱机箱好比人的衣服，除了外观好看外还能保护重要部位。这里就不多说了，说多了都是泪，秀才说不过倔的兵，我直接推荐算了。酷冷至尊毁灭者经典U3版、酷冷至尊开拓者U3普及版、恩杰H230、恩杰小幻影、恩杰H2、银欣乌鸦、银欣FT02。
8. 8
电源电源好比人体的血液，血液不正常对人体整体的功能都有危害，一台电脑最重要的是电源，电源功率小了，那么恭喜你，你可以提前给你的设备挖好坑买棺材了。目前市面上的电源都是贴牌货，没有好的电源牌子，只有好的电源型号。有条件尽量不要用电脑城4大坑爹之王：航嘉、长城、金河田、大水牛之流的电源，低端电源已被黑出翔，个人建议首选台系或台系代工的电源。安钛克VP350P、安钛克ECO400、安钛克ECO520、安钛克TPN550、安钛克HCP1200海韵S12II-330、海韵S12II-430、海韵S12II-520、海韵S12II-620在确定各硬件后，可以去各个官网查看硬件的参数，然后把功耗加起来基本上就是要买电源功率的大小了，至于电源功率余量留多少看个人需求。
9. 9
显示器有人喜欢屏幕大，有人喜欢16：10，众口难调很难作推荐，反正认定三年质保的大品牌显示器就没错。为了大家的视力，请不要选择18.5、20、21.5这几个尺寸的显示器，”。需要注意的是显示器尺寸越大标准的分辨率越高，对机器的配置的需求也越高。
篇三：velvet序列的组装
每日一生信--velvet序列的组装（终结版）
(2014-03-02 10:48:06)
（参数怎么修改见下面）
make clean 就是删除，然后再重新安装
其他一些设置：
make color 设置不同的颜色？？？
make 'MAXKMERLENGTH=127' #默认的最大kmer为31，这个需要修改
#处理的数据的管道数，不同的管道可以用来处理来自不同插入文库或者不同样品（这里面有一个问题：宏基因组算是多个样品吗？），而这个值越大，对内存消耗越大，而我的样品，默认的为2，我怕内存不够，暂且设为2吧
make 'BIGASSEMBLY=1' #read的ID保存在一个32字节的字符串中，如果你有大于22亿（2.2G） 的reads，你就需要更多的内存，设置为1，是调用更多的内存。
make 'LONGSEQUENCES=1' #read的长度保存于16字节的字符串中，如果长度大于32kb,就意味着要更多的字节来存放字长度，所以可以直接设置为1，调用更多的内存，但是跟上面一样也会消耗很多的内存。
make 'OPENMP=1' #可以利用多个cpu，但是速度不会有指数的变化，因为只有一部分可以利用多线程
make ‘BUNDLEDZLIB=1’ #如果不能使用系统默认的zlib，也可以造常运行。 也可以直接这样，一致性到位： make
'MAXKMERLENGTH=127'
环境变量：
export PATH=$PATH:/sam/velvet/bin
#注意我把安装好后的velveth,velvetg两个程序罗到了新建文件夹/bin里面，这样调用这两个程序的时候，就直接可以在终端的任何地方输入velveth,而不用cd 到程序目录，然后./velveth罗。
也可以这样来改环境变量：
sudocpvelvetg /usr/bin/
sudocpvelveth /usr/bin/
运行环境：
64bit，（GNU Compiler Collection，GNU编译器套装，是自由的类Unix及苹果计算机Mac OS X 操作系统的标准编译器），>12G内存
主要工作原理图：
1、Bruijn算法
给定的数据总是存在着冗余信息，因此，算法的使用很重要。当前大多数是用的overlap-consensus-layout算法，它的每一个read都是单独的实体。而Bruijn算法，将分析基于observed words（或者k-mers）。给定k-mers，不管发现多少次，都是唯一的node。此外，他可以无差别的容纳long和short read的混合物。
构建Bruijn图关键在于对所有的reads进行hash。Hash值通过设置参数给定，或者是默认的21。这对所有的序列进行成对比对时会减少时间，一旦所有的reads已经被hash，由k-mer node可以追溯他们的每一个路径。增值覆盖率和创建arcs就属于这种方法。
2、错误的移除
错误移除算法：Tour Bus，对没有错误连接的graph进行移除。这要确保基因组中低覆盖率的唯一的点没有被破坏。因此，这一步在画图之后进行。
这里有两种类型的错误：tips和bubbles。Tips：起源于低质量的read的结尾部分没有任何的重叠。Bubbles：他产生于长read的中间或两个错误的read结尾部分重叠。
首先去除tips，由长度和覆盖率来定义。然后去除bubbles，运用的是和Dijkstra’s算法相似的算法，最后低覆盖率的点会被淘汰。
使用：
合并两个fastq文件，如果是fasta,则需将下面的代码中fastq改为fasta
/sam/velvet/contrib/shuffleSequences_fasta/shuffleSequences_fastq.pl
output_forward_paired.fqoutput_reverse_paired.fqpaired.fq
第一步：建立哈希索引
直接对fastq格式的原始文件进行处理，首先是用velveth命令建立hash表子集 输入./velveth会出来使用帮助：
./velveth directory hash_length {[-file_format][-read_type][-separate|-interleaved] filename1
[filename2 ...]} {...} [options]
directory : directory name for output files
hash_length : EITHER an odd integer （奇数）(if even, it will be decremented) <= 127 (if above, will be reduced)
: OR: m,M,s where m and M are odd（奇数） integers (if not, they will be decremented) with m < M <= 127 (if above, will be reduced)
ands is a step (even number). Velvet will then hash from k=m to k=M with a step of sfilename : path to sequence file or - for standard input
File format options:
-fasta -fastq -raw -fasta.gz -fastq.gz -raw.gz -sam -bam -fmtAuto
(Note: -fmtAuto will detect fasta or fastq, and will try the following programs for decompression : gunzip, pbunzip2, bunzip2fasta格式）
File layout options for paired reads (only for fasta and fastq formats):
-interleaved : File contains paired reads interleaved in the one file (default)
-separate: Read 2 separate files for paired reads
Read type options:
-short
-shortPaired
-short2 独立的插入大小的文库
-shortPaired2 同上
-long -longPaired针对sanger和454
-reference
Options:
-strand_specific : for strand specific transcriptome sequencing data (default: off)
原来这个可以针对转录组数据啊
-reuse_Sequences : reuse Sequences file (or link) already in directory (no need to provide original filenames in this case (default: off)
-reuse_binary: reuse binary sequences file (or link) already in directory (no need to provide original filenames in this case (default: off)
-noHash: simply prepare Sequences file, do not hash reads or prepare Roadmaps file (default: off)
-create_binary: create binary CnyUnifiedSeq file (default: off)
（大纲）
- Short single end reads:
velvethAssem 29 -short -fastq s_1_sequence.txt
- Paired-end short reads (PE1和PE2是合并的remember to interleave paired reads): velveth -fasta
# Assem为生成文件所在文件夹，31为设置的kmer，一般为奇数，默认的是31，最开始默认最大的也为31，我已经改为127了，-shortPaired双末端模式，interleaved.fna？难道是是它指定的排列顺序？默认的输入文件是fasta格式
- Paired-end short reads (和PE2是分开的)
velvethAssem 31 -shortPaired -fasta -separate left.faright.fa
- Two channels and some long reads:
velvethAssem 43 -short -fastqunmapped.fna -longPaired -fastaSangerReads.fasta
- Three channels:
velvethAssem 35 -shortPaired -fasta pe_lib1.fasta -shortPaired2 pe_lib2.fasta -short3 se_lib1.fa
Output:
directory/Roadmaps
directory/Sequences
[Both files are picked up by graph, so please leave them there]
第二步：根据建立的索引来组装
在终端输入./velvetg 查看说明
Usage:
./velvetg directory [options]
directory : working directory name
Standard options:
-cov_cutoff : removal of low coverage nodes AFTER tour bus or allow the system to infer it
(default: no removal)
-ins_length : expected distance between two paired end reads (default: no read pairing)-read_trkg : tracking of short read positions in assembly (default: no tracking)
追踪段read的位置（默认的是关）
-min_contig_lgth: minimum contig length exported to contigs.fa file (default: hash length * 2)
《12g内存够用吗》
由：免费论文网互联网用户整理提供,链接地址：
http://m.csmayi.cn/meiwen/23100.html
转载请保留,谢谢!
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